澳洲气候研究所在最新公布的一项研究报告指出，若全球暖化以目前的轨迹延续，野生咖啡豆可能在2080年灭绝。
据报道，研究人员说，因气温不断上升和害虫与真菌肆虐，预估全球2050年适合种植咖啡树的农地将减半。一旦咖啡树消失，势必对仰赖咖啡豆维生的全球1.2亿相关人口造成严重冲击，其中许多人住在全球最贫穷的国家。
全球目前有70个国家生产咖啡豆，咖啡产业是其中部分国家的经济骨干。布隆迪59%的出口所得来自咖啡豆，埃塞俄比亚33%，尼加拉瓜17%。多数咖啡农是小农，特别容易受市场起伏不定的影响。
此外，除了因数量越来越少而导致价格上涨，咖啡的风味也可能受严重影响。报告说：“长期而言，咖啡豆的种植面积很可能因不利的气候形态而不断减少。在此局面下，咖啡豆的价格很可能受严重影响。部分主要产区日益极端的气候现象可能造成供应短缺，气温上升则有损风味。若全球均温增加三摄氏度或更多，甚至即溶咖啡也可能受重创。”
咖啡树面临的威胁日益严重，巨变可能随之出现。未来数十年，咖啡豆的生产可能自赤道地区往山区移动，导致森林遭到砍伐。
此外，除了气温上升，气候变迁也可能导致真菌扩散，进而破坏咖啡树。2012年，中美洲出现异常高温与降雨，咖啡叶锈菌随后侵袭咖啡树，造成该地区35万人失业。在哥伦比亚，咖啡叶锈菌已出现在此前无法存活的低温山区。
咖啡果小蠹最早发现于刚果，目前已扩散到许多生产咖啡豆的国家。在240万人仰赖咖啡豆维生的坦桑尼亚，这种害虫已扩大损害的范围。